分部都是直接听命于海军本部的指挥，各个海军分部之间并不存在直属关系，各个海军分部的长官的军衔都是海军上校。
但是现在东海的海军结构却是变成集权式结构，东海海军的最终指挥权落在了罗格镇海军基地的手里。
也就是说，罗格镇海军基地已然成为了东海海军的总部，而这个总部的最高领导，毫无疑问便是林奇这位海军本部中将了。
林奇还对东海的海军建制进行了一系列地位重组，按照伟大航道上海军本部的模式，林奇设立了一个军队统帅，三个海军高层将领。
艾斯德斯作为曾经的帝国将军，军事才能卓越，领兵打仗本来就是她的老本行，管理军队，稳定军心，艾斯德斯都比林奇更加在行，所以林奇直接把东海海军统帅的位置给了她。
林奇则是退居二线，只作为名义上的最高领，但却不插手任何的军队管理和任务安排。
海军统帅给了艾斯德斯，而剩下的三大将领林奇则是给了卡尔、赤瞳和霍斯金。
卡尔作为罗格镇海军基地一直以来的长官，在东海的威望非常的高，东海的这些势力大多都是他联系拉拢过来的。
卡尔功不可没且能力也十分突出，所以林奇给他安排了一