开始，开战后只要太鲁阁部能支持一到两个月，那么对我局势大利！”
日本对台湾的征服是分步骤的，开始只是征讨竭力反抗的华人以及清军残余部队，这些人暴力剿灭之后，又开始扑灭各地的零星叛乱，如此十多年后，儿玉源太郎任台湾总督时，他不再一味强硬杀戮，而是先通过招抚手段，答应反叛者的一切条件，待其降低防御后，已经了解各处反叛者细节的日军突然出兵将这些人一举绞杀，如林少猫等就是如此牺牲。另外，儿玉还通过对清政府施压，勒令对岸的福建衙门通缉逃至厦门福州等地的反叛者，比如简大狮等就是由清廷厦门官方逮捕交由台湾总督府，而后被残酷折磨而死。
一内一外，儿玉源太郎基本把台湾的反叛者剿灭干净，但犹显不够的他又使出一招引蛇出洞，支持孙汶在台湾立足以招募各种反叛势力反清，由此通过孙汶旁边的黑龙会人士，详记与会者细节，对于纳入兴中会体系把矛头对准满清的，大多放过，对于那些还是想一心反日的，则尽数格杀。
这几套办法做下来，岛内一时间大定，是以后面的总督除了稳定现有局面之外，则开始征讨山中的蛮族了——日本人若要开发台湾，需要更多的樟脑和木材，那就要进占本来不属于汉人的部族地区，同时桀骜