和儒学发生激烈冲突的，就是天道教上层的科学神教思想。因为科学神教的思想和道理，同样不是真正的宗教。也是一种和儒学类似的学问。只是一个偏重哲学，一个偏重实学；一个敬天法祖崇古，一个则认为科学可以让未来成为天堂；一个主张孝治天下，以宗族法度为社会基础；一个主张封建民主（周氏的封建民族其实也是部分儒者所向往的，但是在13世纪的儒家中并不是主流），以士爵和天道教作为社会基础。
不过两者在思想理念上的冲突，还不是儒学仇视天道教的主要原因——主要的原因，还在于利益！因为对13世纪的绝大部分儒生而言，孔孟之道，不过是他们取得富贵的阶梯。而陈德兴推崇科学。自然要把科学变成一架通向荣华富贵的阶梯。
这就剥夺了儒生们考试做官，和皇帝老子共天下的利益。
如果让天道教和陈德兴做大下去，那天下百万为了做官发财而学儒的儒生。他们一辈子的所学，可就派不到什么用处了！
所以一个天道教算是把儒释道三家都得罪了，将要面临的抵制也是可想而知的。
“三教不会那么快垮台的，”陈德兴轻轻叹了口气，“一千多年形成的三教合一，不会在短短几年内就破碎的。”