全都剥夺家产，驱逐到蒙元境内，任其自生自灭。
终日枕戈待旦的朱元璋，也迅做出的反应，将籍贯在自己治下的两名儒生，以及另外数十名不肯出仕效忠，依旧奉蒙元朝廷为正朔者，全部抄家，族人押入矿山服役，终生不得释放。
紧跟着，刘伯温、彭莹玉和赵普胜等人，也先后采取了类似行动，一面派遣使节，到扬州探病，一面借着捉拿刺客余党的由头，在各自的治下，展开了一场前所未有的大清洗，将治下那些不肯与自己合作的狂生，全都打成“刺客余孽”，逮捕入狱。
一时间，自黄河以南，凡是红巾军的控制地区，都风声鹤唳，被诸侯们处死、抄家和强行往矿山服苦役的“刺客余孽”，远远过了淮扬大总管府自己的处置的刺客本身数量，以至于街头巷尾，茶馆酒肆，再难闻听议政之声，邻人路上偶遇，彼此相视以目。
唯独反应慢的，是蒙元朝廷，当朱屠户侥幸沒死的消息传到大都之时，察罕帖木儿和李思齐二人所统领的私兵，已经跟淮安军第四军团在黄河南北各做过了一场，前一战，察罕偷渡过河的五千兵马，被第四军团副都指挥使陈德陈至善杀了个全军覆沒，后一场，第四军团乘胜追过黄河以北的两个旅，却陷入了察罕和李思齐的联手包围中，进退两难。