，迁之西内。贬生母皇太后吴氏复为宣庙贤妃，废后汪氏复为郕王妃，削孝肃皇后杭氏谥号，皆称孙太后制行之。二月十九日，郕王死，诏丧葬悉依亲王例。毁所营寿陵，葬之西山，谥曰“戾”，以其后宫唐氏等殉葬。三月初六，英宗复立沂王朱见深为皇太子。
天顺三年（1459年）石彪谋镇大同，明英宗觉其诈，以罪下狱。十月，英宗罢石亨之职，绝朝参。石亨败。
天顺四年（1460年）正月二十四日，锦衣卫指挥同知逯杲等奏石亨怨望益甚，与其从孙石浚制造妖言。而且蓄养无赖，专伺朝廷动静，不轨之迹已著。廷臣皆言不可轻宥，乃下石亨于诏狱。从“谋叛律”应斩，籍其家。二月十六日，石亨瘐死狱中，英宗命革“夺门”功，穷治石亨党羽，由石亨而得官的尽行罢黜，朝署一新。
天顺五年（1461年）七月初二，太监曹吉祥反失败，其家无论大小尽诛。
天顺八年（1464年）正月十七日，明英宗朱祁镇死于乾清宫，年三十八岁。临死罢宫妃殉葬。上尊谥睿皇帝，庙号英宗，葬裕陵。正月二十一日，皇太子朱见深正式即皇帝位，是为明宪宗，时年十八岁。大赦天下，以翌年为成化元年。宪宗即位后不久，为于谦平反，赦免于氏家人。于谦子于冕任兵