，黄巢果断与其分道扬镳，独自率军北返。次年三月，黄巢大军攻破郓、沂二州，斩杀节度使薛崇，顺利返回山东鲁南地区。
一直在湖北一带转战的王仙芝终于没能再次等到皇帝的招安诏书，乾符五年（公元878年）二月，王仙芝兵败黄梅（今湖北黄梅西北），于突围时战死。王仙芝的余部转战至安徽一带与黄巢会合，推黄巢为黄王，号“冲天均平大将军”。
兵势再度强盛的黄巢成为农民起义军当仁不让的领袖。他率军沿黄河西进，再度直逼洛阳。朝廷见关中告急，急忙调集重兵堵截。谁知黄巢避其锋芒，率军突然掉头南下，强渡淮河、长江，突入江西、浙江，甩开唐军主力，开山路七百余里攻入福建，攻克福州。随即又沿海岸南进，进逼广州。农民起义的烈火在江南熊熊燃烧，黄巢大军很快发展到数十万人。
两年多时间，黄巢把流动作战发挥到了极致，率军从黄河之畔一直打到南海之滨，行程五六千里，席卷河南、安徽、江西、浙江、福建、广东、广西，威震大江南北。这两年，堪称他用兵最为鬼神莫测之际，也是跟随他的农民军士兵最快乐的日子。
而朱温在萧县的田间村头积累起来的肉搏技能终于有了用武之地，他的战友们很快发现，这个人不但格斗能力出