，天皇岂能容忍？
甚至于当时有人要向天皇开脱政变军官，裕仁天皇龙颜大怒：“杀戮朕之股肱，如此凶暴之将校，有什么可饶恕的！”
更有甚者，天皇还要考虑眼前海军与陆军之间潜存的较量。
名义上海军调回东京湾的军舰大炮只是想消灭叛军，但枪炮无眼，谁知道炮口抬高一公分会不会误入日本政要甚至天皇裕仁的宫殿。
所以，兵变发生的第三天早晨，日本天皇发表敕令，定性兵变的参加者为叛军，要他们迅速撤离所占地区。
叛变官兵知道天皇已经明确表示不支持他们后，这场兵变已经输了，很快就缴械投降。
对于参加这次事变的大部分士兵与士官，天皇都采取了宽容的态度，而独独对领导叛乱的少壮派17名军官及2名意见领袖被判处死刑。
至此，皇道派一系的势力从此一蹶不振，荒木真崎、川岛林、关东军司令官南次郎、待从武官长本庄繁等高级将领编入预备役，后来的“马来之虎”山下奉文大将此时也从陆军省军事课课长的要职被拿掉，改派朝鲜。
到1936年8月，军部对近3000名军官作出了空前的大调动。统制派的势力填补了皇道派留下的空白，从此牢牢占据了军方的大权