对客观事物的形式、组织等进行预测的有序的知识的系统。科学还指可合理解释，并可靠地应用型知识的主体本身。
这个解释比较拗口，但朱由校实在是想不到如何用文言文来翻译它，而徐光启他们的翻译又会让一般人根本不明白是什么意思，所以索性就用大白话来解释。
也许是受到对科学解释的影响，科学报通篇都是用的白话文。第一期报纸上，朱由校提出了科学的研究方法应遵循的一般原则有：1、研究程序的公开性；2、收集资料的客观性；3、观察与实验条件的可控性；4、分析方法的系统性；5、所得结论的再现性；6、对未来的预见性。
而至于科学的研究方法，朱由校也专门写了一篇文章来阐述。他认为，进行科学研究，第一是要认识到问题的存在。例如，在研究物体的运动时，首先应当注意到物体为什么会像它所发生的那样进行运动，亦即物体为什么在某种条件下会运动得越来越快（加速运动），而在另一种条件下则会运行得越来越慢（减速运动）。
第二是要把问题的非本质方面找出来，加以剔除。例如，一个物体的味道对物体的运动是不起任何作用的。
第三是要把你能够找到的、同这个问题有关的全部数据都收集起来。例