都司，为明政府管辖黑龙江口、乌苏里江流域的最高地方行政机构。都司的主要官员初为流官，后为世袭。其境内的蒙古、女真、吉里迷、苦夷、达斡尔等族人民，多以渔猎为生。辖区内分置卫所，明朝政府还任命各族首领掌各卫所，给予印信，仍其习俗，统其所属，以时朝贡。贡物有海东青、貂皮、马匹等土特产品，相当于内地的赋税。
建州女真兴起后，奴儿干都司辖区与大明的联系被切断，其朝贡对象改成了建州女真。
明朝战舰的到来，使得奴儿干城沸腾了起来。自宣宗时内迁奴儿干都司于三万卫后，近两百年不见明朝军队前来，但各卫所仍奉明廷为主，很多老人看着船上熟悉的明朝旗帜，不由得泪流满面。
而奴儿干城的繁华也让东海舰队看得目瞪口呆。其实奴儿干城一直是堪察加半岛、千岛群岛、苦夷岛、虾夷岛和大陆黑龙江流域的物品交易点。颜思齐甚至在这里看到了丝绸，真是搞不明白是从哪条路径弄来的。
而在奴儿干都司府现在是有都司的，都司叫周同金，名字是汉人的名字，不过血统如何那就不知道了，据他自己说，其五代祖以后一直都是娶的当地人，但汉人论血脉时只以父系为准，所以不管他血统如何，都是名符其实的汉人。