自当尽职酬恩，何乃寻端沽直？本欲逐款穷究，念时方多事，朝端不宜纷扰，姑置不问。以后大小各官，务要修职，不得随声附和。有不遵的，国法具在，决不姑息”的圣旨就此颁行于天下，算是给了杨涟和东林党迎头一击。
圣旨下发后，东林党人群情激奋，一方面，大家伙继续用弹章“淹没”的办法，持续攻击魏忠贤和阉党，另一方面，一群人便跑去叶向高的私宅，向叶向高施加压力，让他出面力挽狂澜。
之前叶向高不想掺和此事，是有原因的。
要知道，从张四维之后算起，历任内阁首辅大臣大都吸取了张居正死后遭清算的教训，不大愿意揽权，而六部从嘉靖年间起被内阁压制，一早就想伸张独立行政权，如今见首辅主动放弃揽权，便立刻反攻倒算，如此一来，便导致了从万历中后期开始，相权被极大的削弱可。
具体到了叶向高这里，由于他本人的处世方式比较软弱，内阁就更是指挥不动包括吏部在内的几个有实力的大部了，而偏生当下吏部尚书赵南星又是一个强情人物，整顿吏治的时候，大刀阔斧，根本就不和内阁打招呼，简直把内阁当成了空气。
叶向高对此，那是相当的不满，就或托病不出或经常性上疏辞职，一副任由赵南星去碰壁