征军队，然后再从朝中选派将领统兵出征，打完之后，府兵归府，将领还朝，兵将分离。
这样的改变。军队方面变化倒不太大，就是再没有文官来干涉了。皇帝任命出征的指挥官，必须得是现役武将，文官不得统兵。以后不会再有什么总督、巡抚、巡按等来干涉军事指挥。就连内阁首辅，都无权干涉军事。
军队由兵部、枢密院这两大系统分统，然后皇帝通过军机处会议，统领指挥军队。
撤消掉大军区后。以后各省各自为政，一省一个单位，布政司。按察司和省都指挥使司三个班子外，还将在各省也新设参众两院，依照现在中央的三驾马车模式，也实行三权分立，互相监督制衡。省军区将独立在外，统领省内的地方守备部队、民兵和预备役，负责征兵招募以及退伍安置等。
而各野战军镇由总兵统领，他们直接归属五战区统领。
所有军队的军费，都由兵部拟算报内阁通过后提交议院由参议院审核通过，低级军官任免权在省都指挥使和军镇总兵手里，中级军官晋升任命则在兵部手里，高级军官任免晋升则直接归属皇帝。
总督、提督、巡抚这三个高级官职将彻底取消。
以后朝廷更主要的实行垂真条条管理，而不是块状