洪承畴和孙传庭的耳中，彻底的得罪了洪孙二人，使得他们二人对杨嗣昌可以说恨之入骨。
时至九月之后，中原的局势彻底糜烂，崇祯为此可以说是整日愁眉不展，有心想要将杨嗣昌派往河南，主持对刑天军的剿抚，同时令洪承畴干脆先放弃李自成，率部进入河南，加强对刑天军进剿的兵力，可是也就在这个时候，关外的建奴皇太极再一次挥师破关入寇，这一次皇太极调集了十几万大军，兵分两路入关，来势极为凶猛，九月二十二出关，总兵吴国俊醉酒闻之立即率军逃窜，蓟辽总督吴阿衡率领官军余部，死战不退，监军郑希诏临阵脱逃，而吴阿衡和总兵鲁宗文死战大败，鲁宗文当场阵亡，吴阿衡被俘但是不肯投降，还大骂皇太极，被斩断双腿之后残杀。
建奴军入关之后，直逼京师，使得京城大震，也使得崇祯不得不暂时放下了刑天军的事情，转而担心起这一次破关而入的建奴之事了。
九月底京师一带宣布戒严，可是守关的官吏还有兵将在建奴入寇的时候，却纷纷选择了逃走，基本上没有人率兵给建奴军以任何有力的抵抗，使得这些东虏鞑子们如入无人之境一般的开始在京师以北大掠，兵锋直至北京城，崇祯实在是无奈，只得听从了杨嗣昌的建议，下旨调宣大总督卢象升入卫，同