孙传庭驰援济宁，最终导致孙传庭和吴三桂在阳谷县遇伏，全军覆没。
所以陈新甲在这件事上确实有责任，而且朝野之间为了这件事，又将和建奴议和的事情联系在一起，骂陈新甲为国贼，两件事加在一起，如果崇祯再不作出一点举动的话，那么也无法跟朝野交代，于是崇祯只得下旨革去了陈新甲兵部尚书之职，同时下旨将其逮问追究他的责任，但是却并没有立即将他处斩。
但是抓谁贬谁，现在都不是问题的关键，关键的是在孙传庭兵败之后，朝廷好不容易调入关内的大军已经没有了继续进剿刑天军的能力了，更让崇祯担心的是眼下京辅已经没有多少官军坐镇了，一旦刑天贼趁此机会，挟大胜之威，趁势北上攻打京师的话，又该怎么办，难道继续将关外的官军调入关内御守吗？
这么做显然是不行的，刑天贼确实有亡大明之心，可是不见得建奴就没有这等心思，崇祯虽然迫于无奈和建奴议和，但是却很清楚建奴并不是好东西，眼下之所以跟大明议和，是有他们的打算的，如果他继续从关外撤兵的话，挡住了刑天贼，那么一旦建奴趁此机会又撕破脸破关南下的话，他照样也要玩儿完。
所以继续调兵入关是肯定行不通的，于是崇祯考虑再三之后，只能下旨令马科和杨国柱