大清不必在战后收拾这样的一个烂摊子，而且现在福康安也确实拥有比较好的条件，手中兵强马壮，而且喜马拉雅山的南麓还有武毅军在策应配合。
接下来，福康安派严廷良先后收复了定结和定日，廓尔喀军兵力不多，只有数百，面对清军多面围攻，只是进行了象征性地抵抗就撤退了，并没有像传说中那样血战到底。十月六日，福康安领兵行至宗喀以南的辖布基，进攻擦木山隘（今吉隆县宗喀镇南）。是日夜，清军乘雨分兵五路，福康安居中，哲森保等由东西两山夹击廓军营寨，莫尔根保绕到营后偷袭。初七日黎明之时，清兵攻克擦木山梁上的两座廓军石碉楼，斩杀二百余人。八日，清军进至玛噶尔辖尔甲，击溃由济咙前来迎战的廓军。斩杀六百四十余人，俘虏二百余人。十二日，成德、岱森保等部收复聂拉木以南要隘木萨桥。至此，清军扫清擦木至济咙段边境。
十三日，福康安率军由济咙启程，沿吉隆河东岸南下。十四日，清军过藏廓边界之摆吗奈撒，进入廓尔喀境内之热索瓦，与廓军隔热索河对峙。热索河为吉隆河支流，其上有木板浮桥，即热索桥，也是从西藏进入尼泊尔的必经之路。廓兵在热索河北岸索喇拉山上筑碉楼一座，南岸临河有碉楼两座，并将热索桥木板撤去，凭河据守