龙华民对这种方式是持反对意见的人，而相对来说龙华民也比较固执，不够变通，把他留在北京，对清朝的帮助不会很大。
于是商毅也对汤若望南下表示了欢迎，同时也请他和要南下的传教士准备，二十四日一早出发。
而经过了二天的准备，还招集到了四五千余名各种工匠，再加上他们的家属，共计也有一万四五千人，其中有人是愿意跟商家军一起南下，也有人是被强迫的。但不管愿意不愿意，反正就是他们了。同时所有要运走的金银和铜炮也都装好了车。
就在四月二十二日一早，商毅命四团、新团、骑兵营、雇佣兵营保护着车队，先行出发，赶向天津卫。整个车队一共有五千多辆车，一直拉出了十几里远的距离。其中有三千五百多辆车用来装运金银火炮，另有一千多辆是装运粮草等物资，而毎一户工匠还分给一匹驴马，驮载他们自己的东西，或是让老弱者乘骑。而商毅和二团还有侦察连在北京还停留一天，为他们押后。
就在当天晚上，商毅派到山海关的探子也传回了消息，李自成的大顺军在一片石被吴三桂和清军联手，打得大败，正在向北京方向撤退。
商毅接报之后，立刻又招集上一次撤离北京时，留在北京作卧底的吴汉生和一个侦察排。