大局己定，于实事无补。
而马士英把持了朝中大权，自然首先想到安插自己的人，于是说服朱由崧任命阮大铖为兵部右侍郎。
阮大铖其实是东林出身，而且本身也颇有文釆，但后来依附于魏忠贤，并且在崇祯初年，因为在政治投机中站错了队，结果被划为魏忠贤一党，虽然在当年清剿阉党的时候，逃出了一命，但却己被列入《逆案》之中，即为永不录用之意。不过阮大铖于马士英有恩，同时马士英也希望通过引阮大英入朝，为自己加个帮手。
但阉党和东林党本来就是势同水火，不能共存的，虽然过去了十几年，但东林党依然对当年的事情耿耿于怀，因此这一下自然是一石激起千层浪，刘宗周、黄宗羲等人为代表的东林党立刻群起而攻之，不断上书，不仅指斥阮大铖是奸邪之辈，同时还指桑骂槐，责斥马士英不顾先帝尸骨未寒，就欲翻逆案，是浊乱朝政的大恶之事等等。
而阮大铖的事情还没有结果，在左良玉军中当监军的巡按御史黄澍，受左良玉所托，入朝拜见朱由崧谢恩。黄澍也是东林党人，同时又仗着自己有左良玉在背后撑腰，于是拜见完朱由崧之后，就在朝堂上当殿指责马士英为奸臣，力数马士英的罪行。不仅边骂边哭，而且还上前大搧马士英耳光。使在场群