而自己将亲率一军，赶到黄州坐镇，居中指挥侧应。
东线的主将是勒克徳浑，兵力为六万左右，以蕲州为基地，首先攻取东南的广济、黄梅、宿松等地，然后向西北进攻蕲水、罗田。并命驻守凤阳府的谭泰出兵侧应。
西线的主将是怀顺王耿仲明，率领本部人马约五万余人，以徳安府和汉阳府两地为基础，由西向东进攻，首先攻取孝感、黄陂两县，然后进攻黄安，对商家军在湖北地区何治所麻城县，形成夹击之势。并且和耿仲明一齐进攻湖南的韩岱派兵侧应。
同时为了防止商家军再从大别山的北侧迂回，洪承畴又命驻守归徳府的阿山，派出三万人马，进取大别山北的商城、金寨。并且切断商家军向河南方向移动的道路。
这次征剿湖北，清军确实出动了十五万左右的兵力，再加上黄州府地区原来的，以及其他各路侧应、接应的兵力，总计投入的兵力甚致可以超过二十万。也只有这样，才能够保证毎一路的清军都对商家军占有优势，不会再被商家军调动。同时洪承畴也传令各军，必须稳扎稳打，不得轻急冒进，但传令之后，也绝不许拖延，一定要形成四面合围之势，逐步挤压商家军的活动空间。
不过为此洪承畴也不得不从江地的凤阳、归徳两地抽调了相当的