给人以偏安、不思进取的印像。而南京则正好位于这片地区的中心位置，同时又特殊的政治影响力，当年朱元璋正是在南京建基立业，驱逐蒙元，统一天下，而且正好现在南京的人口己大幅减少，空置出大量空闲地区，也有利于城市的重新规划，和安置官员、士兵的家属成员。因此从各方面来说，南京都要比杭州更适合做行政中心。
按照商家预想的计划，在明年下半年的时候，将把自己的行政机构从杭州搬到南京来，而杭州只是作为一个经济中心地区，和主要的对外港口存在了。
另外把行政中心由杭州迁移到南京，说白了就是一次迁都，在彻底击败清廷之前，南京将做为商毅势力的政治军事经济核心存在，估计这段时间相当长夭，不仅是官员和士兵，包括杭州的大户、商人也都会考虑在南京开设分号，工厂等等，因此也会给南京带来大量的人口，有利于加快南京的恢复速度。
因此商毅也打算利用这个机会，按照近现代的城市模式，好好重新规划一番，把南京建成一座新型的城市。现在李岩留守南京，就要开始做一些基础工作了近现代的城市，首先是要有良好的地下排污、排水管道设施和通畅的地面交通，其次是合理的城市布局，工业区、行政区，居民区、商业区都要有十分明确