因此查孔和弗朗西斯科也只好决定，先到邦班牙部去暂躲一时，然后再做打算。
就在这时，从斜刺里忽然杀出一支中华军，一下子将他们的队伍给冲乱了，弗朗西斯科和阿诺基三世在一起，赶忙向另一个城方的方向逃去，而查孔却被这支中华军给挡住，杀不出去，被打得退进了总督府里拒守。但这时中华军已经基本控制住马尼拉城，于是将总督府给团团围住。
查孔抵挡了一会，也知道现在大势已去，因此只好举手投降。而这时大主教却在阿诺基三世的保护下，终于从马尼拉城里逃了出去，到邦班牙部去暂时躲避。
到下午三时左右，马尼拉城里的战斗基本结束，中华军已经完全控制了马尼拉城，商毅接到消息之后，才带领着众人进驻马尼拉城，这座像征着西班牙在马尼拉的殖民统治的城市，也正式迎来了他的新主人。
这时中华军的士兵正在清理着城市里的尸体和血迹，搜查有没有漏网的西班牙人，并且查封库房，等着有人束清点。不过总督府已经率先清理出来，做为中华军在马尼拉的临时指挥部，商毅和中华军的主要将领都入住到总督里，阿科尼亚住进了对面的奥古斯了大教堂里。而张庚秋等其他主要的华人成员住进总督府傍边的基他房屋里。因为现在马尼拉的居民