虽然这时李华梅舰队封锁了吕宋海域，禁止荷兰船只跃过吕宋，进入南中国海的北部地区，但这个时候的探测技术实在太落后了，而且李华梅舰队的战舰数量在最多的时候，也只有四十多艘，根本不可能将南海完全封锁住，如果荷兰船只顺着中南半岛的边缘行驶，还是有很大的机会躲过李华梅舰队的封锁，另外还可以从吕宋群岛的东侧，走太平洋，经小笠原群岛到达日本，当然这样会将航线大大沿长，而且在途中基本没有任何的补给地点。
不过三艘荷兰战船的到来，也使徳川幕府士气大増，酒井忠胜立刻下令，自己亲自率领五万大军，进攻长州藩，其余的五万大军分驻江户和四国，防备米泽、贺佐、仙台等藩，日本本来就只有巴掌大的地方，因此幕府军很快就集结出动，向长州藩发动进攻。
长州藩位于日本本州岛岛的西南部，也就是后世的山口、广岛一带地区，领地为三十七万石，藩主为毛利氏，第一代藩主毛利元辉在关原合战中担任西军（即丰臣军）的主将，因此最受德川幕府的猜忌，而且这一次倒幕，也是由长州藩带头挑起来的，自然也就成为徳川幕府的第一个打击的对像。
而徳川幕府内部发生的变化确实让倒幕派没有预料到，因为从江户得到的消息，松平信纲有意与倒幕