行了编制，毕竟倒幕军是来自于四十七个不同的大名，如果没有一定的组织，打起仗来非乱不可，因此商毅将倒幕军平均分成三个大队，分别由毛利广纲、锅岛胜茂、有马忠赖三人统领，而每个大队中，又分为三个小队，除了毛利广纲、锅岛胜茂、有马忠赖三人各直领一队之外，另外六名主将分别是：人吉藩藩主相良赖乔、柳河藩藩主立花鉴虎、冈藩藩主中村清久、广岛藩主浅野纲晟、足守藩藩主木下利贞、土佐藩藩主山内丰昌。
这样总计将十二万大军分成九个小队，每队一万人到一万五千人不等，在战斗中也就可以方便调派。
七月二十九日，中华军率领着倒幕大军，到达彦根城前。
而这时在彦根城前，几位守城的大名为在为如何抵挡中华军的进攻而争论不体，因为现在熊本、大阪两城都相继失守，战斗的过程也传到彦根城里，城主井伊直孝就认为中华军的火炮过于厉害，彦根城的城墙还不如熊本、大阪两城，因此一但守在城里，就可以让中华军在城外从容的布置火炮，守城是肯定守不住的，不如出城与中华军进行野战，这样一来，中华军的火炮也就失去了作用。
火炮在野战中的作用不大，这是日本人的常识，而另外三人中，松平纲隆支持井伊直孝的建议、而松平