搁了半天的时间，无法再对噶尔丹进行追击，只好作罢。
这次阻击中，怯薛表现出了对大汗的忠心，宁愿自尽也不表露大汗的身份，否则尽管噶尔丹先逃到了半日，这队明军恐怕也不会放弃追捕。
半个月后，当噶尔丹回到科布多时，又遭到重大打击，先回到科布多的策妄阿拉布坦不但将财物、牛羊抢掠一空，还将他的妻子阿奴等人全部俘虏带走。
望着被抢劫一空的科布多，噶尔丹惊怒交加，此时他的身边只有二百怯薛，可谓到了山穷水尽。
不过，噶尔丹表现出他的坚强，并没有被了策妄阿拉布坦的叛乱击倒，迅速与西藏的第巴桑杰嘉措、青海的博硕克图济农等台吉联系，得到了一部份粮食和牲畜接济。
虽然噶尔丹恨不得立即砍下策妄阿拉布坦的脑袋，只是他还是咬牙低头，通过第巴桑杰嘉措、博硕克图济农等人的调解，以允许策妄阿拉布坦半独立的形式，让策妄阿拉布坦将妻子阿奴和一部份财物归还。
对于策妄阿拉布坦，噶尔丹并不担心，只要他稳定下来，擒杀策妄阿拉布坦易如反掌，唯一让他担心的就是明军的进攻。
取得对噶尔丹的大胜后，明军开始了对漠北之地的进攻，仅用了一个月的时间，明军已经将阿尔泰、乌里雅