矛盾不浅，以至于很多时候都需要有其他元老调和，两人才能一起公事。宋、陈两人的矛盾激发还是在去年由宋教仁提议成立国民党之后。
国民党成立大会上选出九名理事，组成国民党的领导核心——理事会。由于孙中山、黄兴宣布退出政坛未上任，实际理事只有七名。他们是宋教仁、王宠惠、王人文、王芝祥、吴景濂、李烈钧及蒙古人贡桑诺尔布。陈其美本来没指望自己能够当选理事，因此虽然递了名字最后没见到也并没有多感觉到意外。只是他本以为凭借自己在党内的威望完全可以竞争国民党参议的，谁料到最后的名单中还是没有他的名字。后来一去询问先生，才知道是宋教仁跟拦了下来，借口是‘刺陶案’影响不好，其本人不适宜担任参议。也因此两人之间关系便恶了下来，陈其美甚至多次在醉酒时怒道早晚有天要收拾了他。
两人之间的关系如此之差，但是陈其美却在宋教仁离沪之前为他召开宴会。不过在宴会上两人闹得十分不开心之后，他却又在宋被刺之后他表现的更加反常，竟然一反常态的积极为他奔走，还在他过世之后自己掏钱为他购买棺材、张罗后事。这里面的若是没有古怪，说给谁听谁都不相信。
这种种的不和谐，直到情报司结合北京站发回来的一些情报之后