午4点20分，日本陆军将领上川晋元向鸟村速雄发电，正式宣布陆军已经肃清巴达维亚城中的荷兰抵抗力量。
巴达维亚战役结束当晚，日本召开特别会议，宣布将支持苏门答腊岛的万丹等复国武装的独立主张，日本海军将协助反抗势力继续同邪恶荷兰作战，直到荷兰接受苏门达腊独立现实。同时，日本外相面对英国驻日大使的指责，强硬回复道：“当前荷兰之东印度殖民当局对我日本侨民多有敌视，累有伤害我两国感情之举动。我国多次警告、交涉无果。大日本帝国乃负责人之政府，当为全体国民之利益与安全负责。当国民之权益受到荷兰殖民当局损害时，我帝国有权利出兵保护海外侨民之安全！”
当然，他仍向英国驻日大使表示，“冲突一如中露两国之纠纷，日荷之矛盾将仅局限于我二国之间，不会影响协约国之整体利益！”
第二日，日本宣城受万丹国复国武装的邀请，从第八师团抽调一个联队，在日本南进舰队第一舰队的掩护下，浩浩荡荡的数十艘船舰穿过爪哇岛跟苏门答腊岛之间的狭窄海峡，正式向困守苏门答腊岛上的荷兰殖民地军队发动进攻。
9月20日，日本南征军向国内发送一封电报，被中国方面截获。经过中国方面的情报破译，第二日日本已经全