尔衮为奉命大将军，豪格、阿巴泰为副，统左翼军；大贝勒代善之子岳讬为扬武大将军，杜度为副，统右翼军。两军合力，为此战主力。此外，为防止山海关及宁锦等地的明军抽兵回援，黄台吉本人也预备亲率一军前往山海关牵制。
九月廿二，清兵右翼军从密云东北墙子岭拆边墙分四路越过燕山入塞，屡战屡捷、缴获甚多，总督蓟辽兵部右侍郎吴阿衡亦被打死。六日后，清兵左翼军也由燕山青山关拆边墙犯境。明军因早先抽调兵力抗击清兵右翼军而疏于防备，左翼军沿着青山关、董家口、青山营一路前进，所到无阻。
明廷大震，礼部尚书兼东阁大学士杨嗣昌秉持灭寇为先的策略，力主议和，崇祯摇摆不定，一边先调宣大总督卢象升率兵入京拱卫，一边又让兵部尚书陈新甲主持和谈事宜，与清兵私下接触。到了十月，左右两翼军会合于京城近郊通州，黄台吉则兵分三路，在宁锦地区穿插，虚张声势，策应入塞之兵。
赵当世接到北事情况已是近十月中旬，崇祯以来，清兵犯边屡见不鲜，但今时不同往昔，根据从陈洪范及前来诰封的中官处得来得来的消息以及各省间流寇势力每况愈下的实情分析，赵当世再次判断，陕西、河南、湖广三省官军的部署将因此发生天翻地覆的变化。