神木寨城防层次分明，阵地从城外十多里便铺展开来，由外向内划分为荒芜圈、警戒圈和城防圈。
距城十五里范围内是荒芜圈，实行坚壁清野，能撤进城的全部运走，某些必要之处，还将带不走的付之一炬，并向水井投毒。
离城五里处，就进入了警戒圈。延警戒圈边缘，每隔一定间隔，在制高点上设三人侦察哨一座，形成一道警戒线。侦察哨之后，每隔一里半设一联络哨，保持侦察哨与城池间的联络。白天的联络信号是，发现敌军举一帜，接近警戒线举两帜，进入举三帜，向城市而来举四帜，接近城郊举五帜。晚间则以火代帜。此外，各要道和关卡，还要设置三人一组的机动小队，负责侦察和反间谍。这道三位一体的警戒圈，会在敌军进至城郊，即将围城时撤回。
城上远射兵器射之所及便是城防圈的边缘，在此范围内的城外地物被一律铲平，以扫清射角和视线。
在距墙根10米外是没有水的护城壕(不是护城河)。壕内无水，却交错埋插长短不一的竹刺。城门外的护城壕上架设转关桥，这种桥只有一根梁，梁的两端伸出支于壕沿的横木，当敌人行至桥上时，拉动机关使横木缩回，桥面便会翻转，令敌坠入壕内。
在护城壕后，附加着一道木篱或夯土的矮