。上元元年，于阗王伏阇雄击走吐蕃，亲自入唐，唐在于阗设毗沙都督府，下辖6城等10羁縻州，任命伏阇雄兼都督。唐玄宗天宝年间，尉迟胜入唐，唐玄宗嫁以宗室之女，并授予右威卫将军、毗沙府都督。安史之乱时，尉迟胜自率兵赴援唐朝廷，乱平后，终老长安。唐肃宗乾元三年，唐授尉迟曜兼四镇节度副使，并管理本国事。他率领当地民众与唐镇守军一起戍守于阗，坚持到唐德宗贞元六年为吐蕃攻占。
9世纪中叶，吐蕃内乱势衰，于阗获得了独立，仍由尉迟氏统治。9世纪末叶，开始和敦煌的沙州归义军政权交往。北宋初，于阗使臣、僧人数次向宋进贡。在11世纪初喀喇汗国攻占于阗，部分民众东逃沙州，甚至远到今青海。明永乐六年派遣使者进贡。
于阗在喀喇汗国的统治下，语言和人种逐渐回鹘化，并皈依了伊斯兰教。后经西辽、蒙古帝国、察合台汗国、叶尔羌汗国、准噶尔汗国的统治，到乾隆二十四年被清军纳入满清治下，清德宗光绪九年置和阗直隶州。
于阗以农业、种植业为主，是西域诸国中最早获得中原养蚕技术的国家，故手工纺织发达。
自前2世纪末佛教传入后，于阗逐渐成为大乘佛教的中心，三国两晋北朝至隋唐，于阗一直是中原佛教的源