而且马士英并非是一无事处的人，在许多方面的能力还强不少东林党人，在南明成立的早期，也未必没有一些振作的想法，如果东林党能够接现实，承认马士英的执政权力，双方精诚合作，到也不是不可能把南明的局面维持下去，只可惜东林党并不甘心接受失败的局面，一心只想斗倒马士英，根本就不顾大局。而且过去了十几年，东林党的斗争手段仍然一点长进都没有，一如当年与魏忠贤相斗时那样拙劣，还是只会上书，也不想想，在东林党和马士英之间，皇帝会支持那一方。
虽然有吴甡在其中尽力周旋，希望能够保持朝廷的和平局面，可惜他一个人的力量实在有限，而东林党内部其实也是一片散沙，吴甡根本就控制不住，结果终于成了现在的局面。
第三卷 离乱篇 第五十二章 山东巡抚
当然南京朝廷在混乱之中，到也不是没干一点正事，首先是要崇祯帝确定庙号和谥号，不过正事也是在争论不休中完成的。
首先给崇祯定庙号是思宗烈皇帝，但南京守备勋臣赵之龙认为这个庙号不是太好，上奏要求改动。朱由崧先是不许。而礼部侍郎余煜对据理力争，说了一大通之乎者也之类的话，也不知道朱由崧听没听懂，反正争论了一番之后，终于改谥毅宗正皇帝。