舰队带着增援湖北的弹药物资，逆江而上，向湖北驶进。
而在南京的多铎得知水师惨败，商家军的战舰一直开到南京附近的江面上，炮轰金川门，也不禁大为震惊，还以为这一次商家军是要全力进攻长江了。因为这时清军在南京城内的守军不足三万，根本防不住南京漫长的城墙，如果商家军派出一支部队在南京附近登陆，攻入南京城里来，也不是不可能的。
虽然这并不意味着南京就一定失守了，但如果让商家军在南京城里站稳脚跟，再想把他们赶出去，可就不那么容易了。多铎可是知道，在阿济格攻取南京的时候，商家军以不足三万的兵力，守在南京城里，和近十万清军对抗了近一个月的时间。因此多铎可是说什么也不敢让商家军杀入南京城里来。
于是多铎也做出了商毅最希望他做出的选择，下令命鳌拜率部渡江，进驻南京驻守。
而就在鳌拜部从庐州重新开拔之后，这一次作战的目地也达到了，于是商毅也下令成进、杨武丞收兵回浙江，暂时驻扎。等待最后的时机。
不过就在这时，福建又传来了最新的消息：隆武帝朱聿键被清军抓获。
原来朱聿键一行离开福州以后，沿海边北进，赶往福宁州。这时清军的兵锋己经到达离福州不足四十里的