国会两院表决即可，不用到场所有代表投票，因此整个过程远远没有像票选正式总统那么复杂和严谨。冯国璋得票两百七十八张，黎元洪得票一百五十四张，吴绍霆正式宣布由冯国璋出任中华民国副总统。
两院议长和副总统的人选得以确立，大会堂休息了五分钟，然后吴绍霆再次登上主席台，正式宣布中央政府的结构和各部部长名单。按照吴绍霆与冯国璋、徐世昌三方的会商结果，决定中央政府采取二元递进级结构，也即设置一名最高首长和两名首长副手。具体的意思是中央政府将保持执政府时期的两个办公厅，一个是常规的政务厅，另外一个是常务厅，也即之前的执政官办公厅。
政务厅与常务厅的职能近乎相同，只是分管不同的政府部门，两个办公厅各由一名长官负责，而这两名长官即属于最高首长副手，由最高首长亲自任命。政务厅分管八大部门，交通部、商务部、财政部、国家安全部（即警察部）、教育部、农林环境部、司法部和民政部；常务厅同样分管八大部门，新闻文化部、国防部、内务部、外交部、中华民国共和银行、科技部以及国家资源管理部。
两个办公厅都隶属于总统府，而政务厅长官还兼任总统府秘书厅总秘书长。秘书厅的职能也进行了全新的规划，不仅负