责总统府侍从官处、政府宣传处等部门，同时还加入政府人力资源管理处、事业单位监督等职能。
之所以成立两个办公厅，并非是多此一举。按照吴绍霆与冯国璋、徐世昌的商议，这么做的目的其一是为了让新政府更快适应结构，毕竟有执政府时期的先例，大家在执行起来更容得心应手；其二多一个元首副手，就能多一个拉拢其他政治势力的机会，元首制推行前期最重要的是凝聚人心、巩固统治权；其三也是最重要的一点，分化政府管理结构也就是分化政府的影响力，吴绍霆正是要通过弱化政府的影响来强化元首的威信。
在公布了中央政府机制之后，吴绍霆正式宣布中央政府两大办公厅长官与十八组织部门部长、副部长的名单。这份名单基本上与执政府时期并无太大的差异，常务厅长官依旧是邓铿，政务厅长官则改任张謇。除此之外，因为选出议员和议长的关系，几个缺额的部长也由新的人选代替：内务部部长为于孜县，民政部部长为孙宝琦、财政部长为周学熙、外交部长伍廷芳等等。
梁启超出任司法部部长，同时兼任总统府首席政务顾问。吴绍霆并没有打算冷落梁启超，只是在这段时间要强化自己的权力，不得不提防来自梁启超的阻碍。再者他让张謇接替梁启超的政务厅长官