制度到了明中期就破坏殆尽，由于盐业的巨大利益，官员、勋贵、太监互相勾结，倒卖盐引，私自夹带，使得商人辛苦运粮到边关获得的盐引价值大为降低，入不敷出之下，再也没有人肯运粮到边关。
到了成化年间，开中制度再也无法执行下去，到了非改不可的地步，成化十年（公元1474年）巡抚右都御史刘敷疏请两淮水乡灶课折银，每引纳银三钱五分，开始了开中纳银的试行，弘治四年叶淇为户部尚书，着手将开中折色推行全国，朝廷正式命令召商纳银运司，类解太仓，分给各边，每引输银三四钱不等，至此开中折色制度正式确立，商人不再需要运粮到边关换取盐引，而是直接交银换取盐引。
开中折色后，朝廷在盐政上的收入大增，张居正主政期间，每年朝廷盐税收入一度高达五六百万两，其中两淮盐税每年贡献二百余万两，除去给边关的各种开销，盐税一年可以节余一百万两，张居正死后，太仓存银因此高达一千多万两，万历年间能够支撑大明进行三大征，实赖张居正留下来的一千万两存银。
现在南明朝廷在盐政上还是继承原来的开中折色制度，只是盐税的收入却少得可怜，以弘光元年为例，朝廷在盐税上的收入不过三十多万两，其中两淮盐税依然占了大半，缴纳了二